延平郡王─鄭成功
江彥震
鄭成功，厡名鄭森，字明儼、大木，幼名福松，為南明政權的將領，隆武帝賜明朝國姓朱，賜名成功，世稱「國姓爺」、「鄭賜姓」、「鄭國姓」、「朱成功」，又因受永曆帝封延平王，稱「鄭延平」。尊稱「延平郡王」、「開台尊王」、「開台聖王」等。
鄭成功之父鄭芝龍曾為海盜，後為南明水師將領，出身明朝福建省泉州府南安縣安平鎮（現分屬泉州市轄下的晉江市安海鎮及南安市石井鎮），母田川氏出身於日本肥前國平戶島（今日本長崎縣平戶市）。鄭成功於1624年8月27日出生在母親的故鄉平戶，六歲時為父親接往福建老家，及長被送往金陵求學。
後繼承發展父業，曾壟斷福建和東洋的貿易，凡福建商船出海均需向鄭氏納稅，若不交稅必遭『倭寇』襲擊。又組織福建移民屯田台灣，因此與荷蘭人的遠東利益衝突。在明朝尚存時，尚與荷蘭人殖民的台灣和睦共處，向荷蘭福爾摩沙殖民當局交稅。而在明朝政權陷落後，鄭成功失去大陸基地，為奪得台灣為落腳點，下令福建商船不與荷蘭人管理的台灣貿易，斷其殖民利益大半，最終成功驅逐荷蘭人的福爾摩沙殖民政府，以台灣為基地建立南明政權。
1645年清軍攻入江南，不久芝龍降清、田川氏在亂軍中自盡；鄭乃率領父親舊部在中國東南沿海抗清，成為南明後期主要軍事力量之一，一度由海路突襲、包圍清江寧府（原明朝南京），但終遭清軍擊退，只能憑藉海戰優勢固守海島廈門、金門。1661年率軍橫渡台灣海峽，翌年擊敗荷蘭東印度公司在臺灣大員（今臺南市境內）的駐軍，開啟鄭氏在臺灣的統治，但不久即病死。鄭成功死後，臺灣民間陸續建立廟宇祭祀，其中以台南延平郡王祠最為重要。
鄭成功父親鄭芝龍是一個海商兼海上走私集團頭目，一生共有5位妻子，其中第二位妻子田川氏是日本人。當時日本當局很重視鄭芝龍，平戶藩主松浦也送宅邸給他居住。明朝天啟三年（1623年），鄭芝龍到日本做貿易時，與當地女子田川氏結為夫妻。1624年8月27日（明朝天啟四年七月十四，日本寬永元年），鄭成功出生於日本肥前國平戶島上的川內浦千里濱。 傳說中田川氏在平戶一處名為「千里浜」的海灘撿拾海貝、海菜時，忽然感到腹痛難忍，便急忙走到一塊岩石上，生下她的長子鄭成功，現在這塊被叫做「兒誕石」的石頭仍然立於平戶海邊 。
鄭成功六歲之前跟隨母親住在平戶，直到父親鄭芝龍受明廷招安任官，才被接回泉州府安平（原晉江縣安平鎮，現安海鎮）居住讀書，該處現為安海成功小學校址。1638年（明崇禎十一年），鄭成功考中秀才，又經考試成為南安縣二十位「廩膳生」之一。1641年，迎娶福建泉州惠安進士禮部侍郎董颺先侄女。1644年，進入南京國子監深造，拜入江浙名儒錢謙益門下；錢謙益為勉勵鄭成功，乃替他起字「大木」 。
同年（1644年，明崇禎十七年），「流寇」首領「闖王」李自成攻破北京，崇禎帝自縊於煤山；隨後明山海關總兵吳三桂引清兵入關，擊破李自成，進駐燕京。明遺臣遂於明太祖首都金陵擁立福王朱由崧登基，翌年（1645年）改元「弘光」。1645年（弘光元年）農曆五月，清豫親王多鐸率軍南下，破揚州、金陵，閣部史可法等人殉國，弘光帝被俘，遭到殺害，弘光朝乃亡 。
1645年，弘光朝覆滅後，鄭芝龍、鄭鴻逵兄弟於福州擁戴唐王朱聿鑑稱帝，於同年七月改元「隆武」。隆武政權成立後，鄭成功得隆武帝賞識，封忠孝伯、御營中軍都督，賜「國姓」朱、改名「成功」、儀同駙馬；鄭鴻逵之子鄭肇基，亦受賜國姓；這就是世稱鄭成功「國姓爺」的由來。
1646年（明隆武二年，清順治三年）起，鄭成功開始領軍多次奉命進出閩、贛，與清軍作戰，頗受隆武帝器重。然而真正握有軍政大權的鄭芝龍，卻無意全力抗清，甚至在清軍南下福建時，命令仙霞關守將施福（又名施天福，施琅族叔）將軍隊撤回隆武朝廷所在地福州。此舉導致清軍攻入閩北時幾乎沒有遭受抵抗。
鄭成功勸阻父親不成，只好率領約二十餘人到孔廟祭拜先師云：『昔為孺子，今為孤臣，向背去留，各行其是，僅謝儒衣，祈先師昭鑒』，出走金門。鄭芝龍本以為降清後得保家業，加官晉爵；不料清軍征閩主帥博洛背約，將鄭芝龍與諸子一同挾往燕京，更出兵攻打鄭家故鄉閩南南安。鄭成功之母田川氏當時已從日本搬至南安定居，碰上此次劫難，於戰亂中自縊身亡；鄭成功得知母親死後，更加堅定抗清決心。同年農曆八月，清軍攻克浦城、霞浦；隆武帝出奔江西，在汀州遭清軍俘虜，之後絕食不屈而亡。南明帝系旋由桂王朱由榔繼承，改元「永曆 (南明)」。
隆武政權滅亡，鄭成功避走金門，然後開始於沿海各地招兵買馬、收編鄭芝龍的舊部，更在南澳募集了數千兵力；1647年1月（隆武二年十二月），鄭成功在小金門（今日金門縣烈嶼鄉），以「忠孝伯招討大將軍罪臣國姓」之名誓師反清。1647年農曆七月，鄭成功會同鄭彩部隊攻打海澄，失敗；農曆八月，成功又與鄭鴻逵部合圍泉州府城，清漳州副將王進率援軍至，鄭軍不敵敗退。
1648年（清順治五年），原浙江巡撫盧若騰等人來歸，鄭成功蓄積實力後再次出擊，攻克同安縣。農曆五月，鄭軍圍攻泉州；七月，清靖南將軍陳泰、浙閩總督陳錦、福建提督趙國祚等轉而攻擊同安，鄭軍不敵，守將、軍民死傷無數。不久，清援軍抵達泉州，鄭成功乃解泉州之圍，退回海上。
同年，清江西總兵金聲桓、王得仁於江西起兵反清，清廣東提督李成棟亦投向明永曆朝廷，使反清復明的聲勢一時大漲；但各方反清勢力在彼此沒有默契、各自為政的情況下，大多淪為地方性的抗爭。不久後，清廷壓制了江西的金聲桓、王得仁勢力；廣東李成棟軍亦於1649年滅亡。1649年（明永曆三年，清順治六年），鄭成功改奉永曆年號為正朔；永曆帝即冊封他為「延平王」，從此亦有人稱成功為「鄭延平」。
是時，閩南地區呈現混亂的局面，除了明、清的官方部隊以外，到處都有土豪、山賊擁據城寨，相互爭併，並且就近向百姓課收稅金，宛如軍閥；相較於這些地方勢力，鄭成功擁有較完善的軍備，但卻也因為軍隊太龐大，而領土太少，面臨籌集糧餉的重大問題。1649年（明永曆三年，清順治六年）農曆十月，鄭成功決定揮兵南下，除打擊閩南清軍外，也打算沿路收服各地的城寨以為糧源。一個多月下來，從清軍手上攻取漳浦、雲霄等地，亦平定了達濠、霞美等寨；十一月，鄭軍攻詔安不克，乃決定轉入粵東，經分水關至潮州一帶征討不合作的零星勢力；至隔年五月之間，又次第收服了潮陽以及周邊許多山寨。
潮州守將郝尚久雖已於1648年隨李成棟反清，但曾襲擊施琅、鄭鴻逵等部，也曾拒絕鄭成功聯軍的要求，並在鄭軍攻打新墟寨時派兵與之為難，與鄭成功素有嫌隙。1650年（永曆四年）農曆六月，鄭成功軍隊行抵潮州，便以郝尚久立場「不清不明」為由，出兵擊之；郝部不敵，退守府城，揭陽、普寧、惠來等縣盡入鄭軍之手。不久，清軍再次攻入廣東；郝尚久背腹受敵下負氣降清，引清軍入潮州城以抗鄭軍。鄭軍圍困潮州城三月不克、士氣低落，又面臨糧餉接濟問題，只得於八月解潮州圍退回閩南。
1650年（明永曆四年，清順治七年），時鄭成功族叔（一說族兄）鄭彩、鄭聯的軍隊領有廈門。鄭成功退回閩南之後，為了拓展實力乃藉口鄭聯在廈門橫徵暴斂、使民不聊生；採取施琅的獻策，用計圖取廈門。永曆四年中秋節，鄭成功趁著鄭彩離開廈門的時機，前往廈門拜訪鄭聯，鄭聯大意並未設防，慘遭刺殺身亡。不久，鄭彩得知鄭聯的死訊，更加不敢與鄭成功作對，回到廈門便將兵權都交了出來；鄭成功自此接收了鄭彩、鄭聯大部分的部隊，並且實際取得廈門、金門作為根據地。
同年農曆十一月，清平南、靖南二王率數萬鐵騎攻入廣州；鄭成功奉敕南下勤王，令叔父鄭芝莞留守廈門。十二月，鄭成功抵廣東潮州揭陽，與鄭鴻逵會師；兩人商討後，決定由鄭成功繼續率軍南下勤王，而鄭鴻逵則移師往廈門協防。同年，魯王在閣部曾櫻等人陪同下，來到廈門投靠鄭成功，被安置在金門。
1651年（明永曆五年，清順治八年）正月，鄭成功抵南澳。農曆二月二十五日，鄭軍艦隊於鹽州港附近遭遇風暴，鄭成功的主船險些解體、翻覆，幾乎所有船上器具，包括鼎灶都一併丟失；據記載當時船上甚至連食物都無法準備，鄭成功本人也連餓兩餐。直到隔天下午風雨漸歇，鄭成功的主副座船才得以回到岸邊與艦隊會合。此乃鄭成功本人於海上遭遇最大的一次凶險，事後鄭成功也重賞主副中軍船的兩位駕駛。
同年農曆三月，鄭軍抵達廣東大星所（今廣東惠東）。另一方面，清福建巡撫張學聖得知鄭成功的主力軍隊已經前往廣東，廈門防務鬆散，似有可趁之機；乃命令馬得功、王邦俊等趁虛攻擊廈門。馬得功挾持身在南安的鄭芝豹，命其交出船艦渡載清軍往廈門，並且順利在海面上擊敗鄭軍。面對清軍來襲，負責廈門防務的鄭芝莞未戰先怯，只顧著將財物搬運至私人船上逃亡；使得清軍相當輕鬆就攻破廈門，並將鄭家的積蓄、裝備掠奪一空。由於事出突然，董夫人與鄭成功長子鄭經只來得及攜帶祖宗牌位避於海上逃過一劫。清軍僥倖偷襲得逞之後，卻沒打算留在廈門與鄭軍決戰，於是滿載戰利品即返回內陸。這時趕赴廈門支援的鄭鴻逵，正好於海面遭遇返航之馬得功部隊，將其圍困，卻被馬得功威脅將害其母、兄（鄭芝龍）性命，無奈之下只好放走馬得功。不久，鄭成功於廣東得知了廈門遭襲擊的訊息；原本他仍堅持繼續南下勤王，但終因上下將士思歸，哭聲遍聞，乃不得已班師回廈門。收復廈門後，鄭成功追究起責任，將怯戰以逃的叔父鄭芝莞斬首；而放走馬得功的鄭鴻逵則交出兵權、自請退隱東石鎮白沙，不再過問政事。
同年農曆五月，鄭軍大將施琅擅自處決鄭成功麾下部將曾德，鄭成功以此為由欲誅施琅全家；施琅雖在友人幫助下逃脫，但父親、胞弟均遭處死。經此事件，施琅與鄭成功結下大仇，乃再度降清。
1651年（明永曆五年，清順治八年）下半年，鄭軍在閩南小盈嶺、海澄（今龍海市）等地戰鬥，獲得了磁灶戰役、錢山戰役和小盈嶺戰役的勝利，克復平和、漳浦、詔安、南靖等地。年底，包括定西侯張名振等人皆來投靠，使鄭軍的聲勢愈形高漲。
翌年（1652年，明永曆六年，清順治九年）農曆正月，清海澄守將赫文興向鄭成功投降。二月，鄭軍攻長泰，清朝派遣陳錦率大軍前往救援；兩軍於江東橋展開大戰。鄭成功仗著對閩南地形較為熟識，在江東橋附近安排了許多伏兵，大敗陳錦，殲滅多數清軍，取得江東橋戰役的勝利。不久即攻下長泰。
攻克長泰之後，鄭成功集結大軍進攻漳州府府城，將之層層包圍。四月，清軍為解漳州之圍，於是募集百艘船艦進犯廈門，攻鄭成功所必救。鄭成功遂派陳輝、周瑞等率領百餘艘戰艦迎擊，於崇武大敗清軍，取得崇武戰役的勝利。鄭軍在海上大捷，因而對漳州城的施壓沒有稍減；然而漳州守軍亦相當頑強，使得圍城的勢態持續超過半年。
幾個月下來，漳州城內的水糧已竭，一碗稀粥索價白銀四兩，居民以老鼠、麻雀、樹根、樹葉、浮萍、紙張和皮革等物為食，士卒、百姓餓死者不計其數。據說當時，城中軍民互相爭奪食物，即使家中有食物者也不敢烹調，因為一旦被發現燃起炊煙的人家就會被搶，更傳說有人吃人肉的慘況發生，史載「城中人自相食，百姓十死其八，兵馬盡皆枵腹」。1652年（永曆六年，清順治九年）農曆九月，清軍將領固山額真（都統）金礪率領了萬人大軍開抵福建，進入泉州府；鄭成功才下令解除漳州之圍以待敵軍。鄭成功將部隊佈置於江東，欲用擊敗陳錦的同樣方式，來伏擊金礪軍，但卻遭金礪識破，兩軍展開混戰，鄭軍提督黃山、禮武鎮陳俸、右先鋒鎮廖敬、親丁鎮郭廷、護衛右鎮洪承寵都在激戰中陣亡。鄭軍於交戰失利後，只能撤退以確保海澄、廈門的安全。清軍趁勝收復南靖、漳浦、平和、詔安四縣。
1653年（明永曆七年，清順治十年）農曆四月，金礪進犯海澄，與鄭成功展開激烈戰鬥，雙方都是以銃炮作為主戰武器。在清軍的猛烈砲火之下，鄭成功部隊損失慘重，許多部將戰死；鄭成功見軍隊士氣低落，親臨陣前喊話，也險遭砲擊。五月初七日五更，金礪下令以空炮掩護，派綠營打頭陣，旗兵後續，填河攀柵蜂擁而來，企圖一舉登城，被鄭營所拒。天亮以後，鄭成功偵知清軍火藥錢糧不繼，於是誘敵決戰，趁清軍大舉渡河之際，以火攻大破金礪，取得海澄戰役的勝利，海澄得保安全。海澄戰役以後，金礪被清廷召回京師，雙方再度處於相持局面。
同年（1653年，明永曆七年，清順治十年）農曆五月，清軍兩度大敗後，順治帝敕封鄭成功為「海澄公」，鄭成功不接受。八月，雙方於泉安報恩寺內議和，鄭軍得以休兵籌措糧餉，稍事整頓。十一月，順治帝再度敕封，並承諾給予一府（泉州）之地安置兵將，鄭成功仍不接受。
1654年（明永曆八年，清順治十一年），定西侯張名振見清軍已將軍力集中於福建，則江、浙等地防務勢必空虛；於是乃向鄭成功請師，率領百艘戰艦北上，圖取江南地區。張名振的北伐之師沿長江進攻，直達金山寺，威脅江寧府城；但因後援接濟不及，只得回師。農曆二月，清廷再遣使與鄭成功，承諾給予興、泉、漳、潮四郡為封地；鄭成功以「兵馬繁多，非數省不足安插」為由，再拒絕之。八月，清又遣使往議；鄭成功的親弟鄭渡、鄭蔭也在使節之中。鄭成功稱「清朝沒有誠意」，並謂「我一日未受詔，父一日在朝榮耀」，又一次拒絕清朝提出的條件。
同年，南明西寧王李定國與鄭成功聯繫，希望從東、西合力進攻廣東，則明朝勢力得以合流；若再沿長江北伐，攻贛、皖、蘇各省，則復興大業有望矣。鄭成功派林察、周瑞督軍西進，卻因故延誤了與李定國的約期；致使李定國孤軍奮戰，雖克復肇慶，卻於廣州城外大敗而回。李定國本來對與鄭成功會師北伐，抱有很大期待，甚至促成李、鄭連姻來鞏固盟誼；但卻因鄭成功屢愆軍期而誤了大事，李定國對此相當失望。
同年農曆十一月，清漳州協守劉國軒向鄭成功投降，引鄭軍進入漳州府城；漳州總鎮張世耀見大勢已去，與以下官員盡皆向鄭軍投降。十二月，鄭軍分兵進擊，拿下同安、南安、惠安、安溪、永春、德化諸縣，軍隊進入興化地方。
1655年（明永曆九年，清順治十二年），因為明昭宗和鄭成功勢力相隔遙遠，特准鄭成功設置六官及察言、承宣、審理等官方便施政，同時允許他委任官職，武官可達一品，文職可達六部主事。鄭成功每次拜封官員，都請寧靖王朱術桂等明宗室在旁觀禮，以示尊重體制。鄭成功同時將廈門（當時稱中左所）改名為思明州，並建造演武亭，以便鄭成功親自督察官兵操練。
同年農曆九月，清定遠大將軍鄭親王世子濟度率三萬大軍入閩，會同駐閩清軍，準備進攻廈門。鄭成功決定放棄已佔領的漳州、泉州兩府屬邑，並拆毀城牆讓清軍無所屯紮，藉此鞏固金門、廈門的防禦。與此同時，還派遣部將率領舟師兩路進擊，一北上浙江，一南下廣東，令清軍腹背受敵、難以兼顧頭尾。北上鄭軍連戰皆捷，攻入舟山；南下鄭軍雖一度攻取揭陽，卻遭到清援軍擊潰，死傷慘重。隔年四月，濟度調集各路水師進攻廈門，於圍頭海域遭鄭軍痛擊，清軍大敗而歸。鄭軍取得泉州戰役的勝利。1656年（明永曆十年，清順治十三年）農曆十二月，鄭成功部隊又在閩東北取得護國嶺戰役的勝利。
南征舟師返回廈門，鄭成功議處敗戰之罪，原本要處死蘇茂、黃梧、杜輝，但是在眾將跪地求情之下，鄭成功決定將蘇茂一人斬首，黃、杜則戴罪圖贖。後鄭成功命黃梧鎮守海澄，還特別囑咐黃梧以戴罪之身應力圖建功；但是黃梧知道鄭成功一向治軍嚴苛，害怕自己一旦再犯錯就會送命，於是便與副將蘇明商議，決定向清朝投降，獻出海澄縣城。海澄是鄭成功多年來投注了相當多人力、物力建造起來的堅固堡壘，黃梧的投降無疑給了鄭成功一大打擊。
起兵後的十多年，鄭成功的據地仍然只以金門、廈門等閩南沿海島嶼為主。但鄭成功完全控制了海權，一方面深入內陸廣設商業據點〈山五商〉，開闢貨源以和外國人貿易、走私來累積資金；一方面以此募兵（包含日本人、白人、黑人等外籍傭兵）及進口盔甲、銃砲、刀劍等武器來籌備軍力、軍備；又以內陸的商業據點為基，發展反清復明的情報組織洪門。
1658年（明永曆十二年，清順治十五年），鄭成功統率水陸軍十七萬與浙東張煌言會師，大舉北伐。大軍進入長江之前，於羊山海域遭遇颶風，損失非常慘重，只得暫且退回廈門。翌年（1659年，明永曆十三年，清順治十六年），鄭成功再次率領大軍北伐，會同張煌言部隊順利進入長江，勢如破竹，接連攻克鎮江、瓜洲，接連取得定海關戰役、瓜州戰役、鎮江戰役的勝利，包圍江寧府城（原明南京）。張煌言部亦收復蕪湖一帶十數府縣，江南一時震動，百姓紛紛剪去髮辮脫去旗袍並哭聲言道：「時久不見大明衣冠矣！」後因鄭成功中清軍緩兵之計，遭到清軍突襲，使明軍大敗，損兵折將，包括潘庚鍾、甘輝、萬禮、林勝、陳魁、張英等大將皆死於此役。鄭成功兵敗後，試圖攻取崇明縣，做為再次進攻長江的陣地，卻久攻不克，只好全軍退回廈門。南京之戰可說是鄭成功生涯當中最輝煌及重要一役，卻是先盛後衰，大敗收場，使鄭成功反清大業受到重大挫折。1660年（明永曆十四年，清順治十七年），在福建海門港（今龍海東）殲滅清將達素所率水師四萬餘人，取得廈門戰役勝利，聲威復振。
自從1647年1月在小金門（今金門縣烈嶼鄉）起兵抗清後，鄭軍轉戰浙、閩、粵等行省東南沿海，多次幫助明朝宗室與民眾渡海定居台灣及東南亞各地。此外，鄭成功讓華商領取鄭府令牌和「國姓爺」旗號，以幫助保護華人在海外經商時的安全；當時確有很多海外華商採取此法，而得以安全出海經商。然而，統領數萬人的大軍抗清，卻始終無法取得較大的根據地，鄭成功被迫必須通過海外貿易籌備糧餉。當時荷蘭人常劫奪鄭氏和海外華人至東南亞商船，鄭成功多次派出水軍打擊荷蘭艦隊，並於1656年到1660年期間兩次警告荷蘭人，除非荷蘭人停止劫奪華人的商船，鄭氏將不會與荷蘭貿易。
北伐南京失敗後，鄭成功所部元氣大傷，並且面臨軍糧不足的問題；為了解決大軍的後勤給養問題，鄭成功決定聽從何斌之建議奪取時由荷蘭東印度公司支配的台灣島。1661年（明永曆十五年，清順治十八年），鄭成功親率將士二萬五千、戰船數百艘，自金門料羅灣出發，經澎湖向台灣進軍。荷蘭當局於台島西南建有兩大防禦要塞，一為位於大員（今台南市安平區）的熱蘭遮城（Fort Zeelandia），二為位於台江內陸赤崁地方（今台南市中西區）的普羅民遮城（Provintia）。同年陽曆四月十二日和二十二日，鄭成功兩次寫信給揆一，令其投降。使者說：「此地非爾所有，乃前太師練兵之所。今藩主前來，是復其故土。後來《臺灣通史》收錄〈與荷蘭守將書〉則與當時荷蘭所記書信不同，因此〈與荷蘭守將書〉被學者認為可疑。陽曆4月30日（農曆四月初一），鄭軍經由鹿耳門水道進入台江內海並於禾寮港（今台南市北區開元寺附近）登陸，意圖先求取防禦薄弱的普羅民遮城。隨後鄭軍在台江海域與荷蘭軍艦展開海戰，擊沉荷軍艦赫克特（Hector）號，取得台江內海控制權，並同時在北線尾地區擊敗荷蘭陸軍，以優勢兵力包圍普羅民遮城。不久，於陽曆5月4日（農曆四月初五）即迫使普羅民遮城守軍出降。農曆五月初五，鄭成功改赤崁為「東都明京」，設承天府及天興、萬年二縣。
在取得普羅民遮城做為據點之後，鄭軍隨即由海、陸兩面圍困熱蘭遮城。由於考慮到兩萬大軍的糧餉調度不易，鄭成功並沒有做持久戰的打算，一開始即對熱蘭遮城施壓，試圖脅迫荷蘭軍隊投降。遭荷蘭大員長官揆一（Frederik Coyett）拒絕其投降要求之後，鄭成功一度下令強攻熱蘭遮城，卻遭遇荷軍極頑強抵抗，鄭軍損失慘重。由於強攻不下，加之大軍糧食短缺，使得鄭成功被迫改變策略，派出大部分的軍隊至南北各地屯田、徵收錢糧，以解大軍乏糧的燃眉之急，對熱蘭遮城改採長期包圍的戰略。
同年（1661年，明永曆十五年）農曆七月，荷蘭東印度公司從巴達維亞調遣的援軍抵達大員，除了六百多名士兵、十一艘軍艦以外，增援部隊亦為熱蘭遮城帶來大量補給品與火藥。時鄭成功的軍力仍分散台灣各地實行任務，駐守於大員以及普羅民遮城市鎮的軍力預估不到三千，遂使荷蘭軍重新燃起反撲的希望。七月中旬，停泊於外海的荷蘭援軍遭遇強風侵襲，被迫離開大員海岸，前往澎湖躲避風雨；其中荷蘭軍艦Urck號擱淺，船上人員皆遭鄭軍俘虜。此一變故，使鄭軍獲得整備的戰機，待荷蘭軍艦於八月回到大員海域時，鄭軍雖未能調回多數兵力，卻已然完成作戰的準備。八月中旬，荷、鄭兩軍於台江內海展開激烈海戰，鄭軍大獲全勝，擊沉一艘荷蘭軍艦，並奪取船隻數艘，自此荷軍喪失主動出擊的能力。
農曆十二月，日耳曼裔荷蘭士官Hans Jeuriaen Rade叛逃，鄭成功在其提供之情報的幫助下，砲轟擊毀熱蘭遮城的烏特勒支碉堡，使熱蘭遮城之破終成定局。1662年陽曆1月28日（明永曆十五年農曆十二月初八），荷蘭大員長官揆一修書予鄭成功，表示同意「和談」。幾經談判，荷蘭大員當局終於1662年陽曆2月9日（明永曆十五年農曆十二月二十日）向鄭成功屈服，退出台灣。
鄭成功下令屯墾台灣的範圍，北達噶瑪蘭（今宜蘭縣），南至瑯嶠（今屏東縣恆春），後因大肚平埔族拍布拉（Papora）族大肚王與瑯嶠「番人」的反抗而減緩擴張；鄭成功實際的統治區域大約是從二林（今彰化縣二林鎮）到茄藤（今屏東縣佳冬鄉）的範圍之間。
1565年，西班牙開始殖民統治菲律賓群島；1603年和1639年，西班牙殖民當局兩次屠殺在最大島呂宋的華僑華商，死亡人數高達五萬餘人。在得知菲律賓華僑的處境後，1657年，鄭成功曾經致函給爪哇島巴達維亞的一位華僑甲必丹，要求他停止與菲律賓的西班牙殖民者進行貿易往來。鄭成功曾多次對菲律賓華僑表示關切，並提出要率兵攻取菲律賓，以懲罰西班牙人。
1662年，鄭成功攻下台灣後，4月通過義大利籍神父李科羅向菲律賓的西班牙總督遞交國書，譴責其殺戮掠奪華僑的罪行，令其「改邪歸正，俯首納貢」，但西班牙人反因此在馬尼拉進行了第三次對華僑的屠殺。鄭成功聞訊大怒，決定揮師征討，為華僑報仇。他一面撫恤安置從菲律賓逃到台灣的華僑，一方面組織籌備軍隊，派人暗中與在菲律賓的華僑聯絡，以便到時可裡應外合，但尚未出兵，他得知兒子鄭經在廈門跟乳母陳氏通姦，鄭成功勃然大怒，命自己的堂兄鄭泰斬殺鄭經，鄭泰因不忍而抗命。鄭成功盛怒之下，又患瘧疾，不久於1662年6月23日病逝。後來，其子鄭經也於1670年和1671年兩次準備派艦隊征討馬尼拉，但因為三藩之亂，鄭經率軍西渡中國大陸，支援福建的耿精忠而未能實現。
1661年（清順治十八年）清順治帝崩，皇三子玄燁繼位；鄭氏降將黃梧向清廷建議「平賊五策」，內容包括長達20年的遷界令，自山東至廣東沿海廿里，斷絕鄭成功的經貿財源；毀沿海船隻，寸板不許下水；同時斬成功之父鄭芝龍於寧古塔（今黑龍江省牡丹江市）流徙處，（一說斬於北京菜市口，即今府學胡同西口，元代以來的刑場）；挖鄭氏祖墳；移駐投誠官兵，分墾荒地。鄭成功接連聽聞噩耗，加上在台將士水土不服人心惶惶，其子鄭經又與乳母私通，使鄭成功內外交逼，於1662年陽曆6月23日（永曆十六年農曆五月初八）急病而亡，死前大喊：「我無面目見先帝於地下」，抓破臉面而死，年僅39歲。然而根據夏琳《閩海紀要》和江日昇《台灣外志》的記載，鄭成功病情一開始並不嚴重，還能看書、觀台、飲酒，有人(citation?)認為可能是被下毒害死。
據《台灣縣志》記載：「當國姓公臥病的當初，五月初二早，忽天昏地暗，黃蜂大作，初三更風雨交加，台江及安平外海波浪沖天，繼而雷震電閃，如山崩地裂，……初五日，天平雨晴了，初八日，國姓爺歸天。」[20150125]
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